Una vez consultada este problema con los ingenieros de QNAP, la solución para poder recuperar los datos ha sido hacer desde Linux un e2fsck y ha dado resultado.
De hecho siempre que occura esto y tengamos el volumen ISCSI en Ext2, Ext 3, o Ext4 siempre hay que usar el e2fsck para comprobar y arreglar los ficheros. En caso de que el ISCSI esté en formato NTFS, entonces desde Windows tendremos que usar el comando “chkdsk /F C:" siendo C el volumen dañado para compobar y arreglar el volumen iSCSI
Ref: FAQ QNAP Turbo NAS